海底两万里小说主要讲述了博物学家阿龙纳斯、其仆人康塞尔和鱼叉手尼德·兰一起随鹦鹉螺号潜艇船长尼摩周游海底的故事。故事的起因是1866年所发生的一件闹得满城风雨的怪事。当时不少航行船只在海上发现了一-头大“海怪”,  并有船只遭到“海怪”的袭击。美国派遣了一艘战舰对 ”海怪”进行追逐。

法国生物学家阿龙纳斯受邀参加了这次追逐行动。结果，追逐怪物的战舰反被怪物追逐，并遭到"海怪”的凶猛袭击。阿龙纳斯和他的两位同伴落水，被“海怪”所救，此后便跟随"海怪”周游四海，探尽海底秘密，历尽艰辛和风险。最后，大家因不堪海底世界过于沉闷的生活，又设法逃走，重回陆地。